El genoma completo de un nimavirus o endógeno (Nimav-1_LVa) del camarón patiblanco del Pacífico Penaeus (Litopenaeus) Vannamei

#FUCOBI y #GIRi serán beneficiarios de la patente de la secuencia del genoma del camarón SPF Penaeus vannamei de USA elaborada por la Dra. Acacia Alcívar-Warren, por el descubrimiento del virus de la mancha blanca integrado ya en el genoma del camarón SPF que llevamos a Taura, publicada en Genes, : "The Complete Genome of an Endogenous Nimavirus (Nimav-1_LVa) From the Pacific Whiteleg Shrimp Penaeus (Litopenaeus) Vannamei".

El virus del síndrome de la mancha blanca (WSSV), el único virus del género Whispovirus de la familia Nimaviridae, es uno de los virus más devastadores que afectan a la industria camaronera. El conocimiento sobre este virus, en particular, su historia de evolución, ha sido limitado, en parte debido a su gran genoma y a la falta de otros virus de vida libre estrechamente relacionados para estudios comparativos. En este estudio, reconstruimos un genoma consenso de nimavirus endógeno de longitud completa, Nimav-1_LVa (279,905 pb), en la secuencia del genoma de Penaeus (Litopenaeus) vannamei raza Kehai No. 1 (ASM378908v1).

Este virus endógeno parecía insertarse exclusivamente en el microsatélite de pentanucleótido telomérico (TAACC / GGTTA) n. Codificó 117 genes putativos, y algunos contenían intrones, como g012 (inhibidor de la apoptosis, IAP), g046 (hormona hiperglucémica de crustáceos, CHH), g155 (innexina), g158 (inhibidor de Bax 1 similar). Más de una docena de genes Nimav-1_LVa están involucrados en las interacciones patógeno-huésped.

Se planteó la hipótesis de que g046, g155, g158 y g227 (como la semaforina 1A) eran genes del huésped reclutados por sus funciones en la regulación inmunitaria. El análisis de secuencia indicó que un total de 43 genes de WSSV pertenecían al conjunto de genes de nimavirus ancestrales / centrales, incluidos cuatro genes informados en este estudio: wsv112 (dUTPase), wsv206, wsv226 y wsv308 (proteína de la nucleocápside). La disponibilidad de la secuencia Nimav-1_LVa ayudaría a comprender la diversidad genética, la epidemiología, la evolución y la virulencia del WSSV.

Pueden ver el artículo completo aquí:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7016691/